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| Registros recuperados : 40 | |
| 3. |  | LIMA NETO, F. P.; SOUZA, E. M. de C.; RIBEIRO, I. C. N. dos S. Caracterização morfológica das inflorescências e da precocidade em acessos de mangueira do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Semiárido. RG News, v. 5, n. 3, p. 47, 2019. Edição do 4º Simpósio Rede de Recursos Genéticos Vegetais do Nordeste, Areia, PB, Nov. 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 5. | | SANTOS, J. M. B. dos; ALMEIDA NETO, M. A. de; CALGARO, M.; SOUZA, E. M. de C.; BASTOS, D. C. Análises físico-químicas da lima ácida Tahiti 2001 sobre o porta-enxerto Índio no Semiárido nordestino. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 13., 2018, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2018. p. 37-41. (Embrapa Semiárido. Documentos, 283).| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 7. | | SOUZA, E. M. de C.; PARANHOS, J. G.; LIMA NETO, F. P.; LIMA, M. A. C. de; ISHIKAWA, F. H. Avaliação de híbridos de mangueira entre as variedades Coquinho e Tommy Atkins, no primeiro ciclo de produção, no Submédio do Vale do São Francisco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. p. 156-159.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 8. | | LIMA NETO, F. P.; LIMA, M. A. C. de; ISHIKAWA, F. H.; PARANHOS, J. G.; SOUZA, E. M. de C. Avaliação de híbridos de mangueira entre as variedades Tommy Atkins e Coquinho, em um ciclo, no Semiárido brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. p. 160-163.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 9. | | LIMA NETO, F. P.; LIMA, M. A. C. de; ISHIKAWA, F. H.; PARANHOS, J. G.; SOUZA, E. M. de C. Avaliação de híbridos de mangueira entre as variedades Tommy Atkins, Palmer e Keitt, em um ciclo, no Semiárido brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. p. 164-167| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 11. | | SOUZA, E. M. de C.; LIMA NETO, F. P.; PARANHOS, B. A. G.; COSTA, C. dos S. R. Avaliação de resistência às moscas das frutas em frutos de acessos de mangueira do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Semiárido durante um ciclo de produção. Revista RG News, v. 7, n. 2, p. 34, 2021. Edição Especial do 5º Simpósio Rede de Recursos Genéticos Vegetais do Nordeste, Mossoró, Nov. 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 15. | | SOUZA, E. M. de C.; PARANHOS, J. G.; LIMA NETO, F. P.; LIMA, M. A. C. de; ISHIKAWA, F. H. Caracterização dos frutos de híbridos de mangueira entre a variedade Tommy Atkins e Haden ou Van Dyke, no primeiro ciclo de produção, no Semiárido brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. p. 192-195.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 16. | | ALMEIDA NETO, M. A. de; SANTOS, J. M. B. dos; CALGARO, M.; SOUZA, E. M. de C.; BASTOS, D. C. Caracterização física e química da lima ácida Tahiti 2000 sobre o porta-enxerto Índio em Petrolina, PE. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 13., 2018, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2018. p. 31-36. (Embrapa Semiárido. Documentos, 283).| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | PARANHOS, J. G.; SILVA, P. I. S. e; ISHIKAWA, F. H.; SOUZA, E. M. de C.; LIMA NETO, F. P. Caracterização fisico-quimica de frutos de híbridos de mangueira da cultivar Tommy Atkins com Haden , Palmer , Kent e Van Dyke. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. p. 200-203| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 18. | | CARVALHO JÚNIOR, J. E. V. de; LIMA NETO, F. P.; LIMA, M. A. C. de; SOUZA, E. M. de C. Caracterização de atributos físico-químicos dos frutos para seleção preliminar de híbridos de mangueira Tommy Atkins. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. p. 180-183| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| Registros recuperados : 40 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
28/12/2016 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F.; VIANA, J. M. S.; VALENTE, M. S. F.; RESENDE JUNIOR, M. F. R.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
C. F. Azevedo, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; F. F. Silva, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal de Viçosa; J. M. S. Viana, Departamento de Biologia Geral, Universidade Federal de Viçosa; M. S. F. Valente, Departamento de Biologia Geral, Universidade Federal de Viçosa; M. F. R. Resende Junior, RAPID Genomics, Florida; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
New accuracy estimators for genomic selection with application in a cassava (Manihot esculenta) breeding program. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4, gmr.15048838, Oct. 2016. |
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DOI: |
10.4238/gmr.15048838 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT. Genomic selection is the main force driving applied breeding programs and accuracy is the main measure for evaluating its efficiency. The traditional estimator (TE) of experimental accuracy is not fully adequate. This study proposes and evaluates the performance and efficiency of two new accuracy estimators, called regularized estimator (RE) and hybrid estimator (HE), which were applied to a practical cassava breeding program and also to simulated data. The simulation study considered two individual narrow sense heritability levels and two genetic architectures for traits. TE, RE, and HE were compared under four validation procedures: without validation (WV), independent validation, ten-fold validation through jacknife allowing different markers, and with the same markers selected in each cycle. RE presented accuracies closer to the parametric ones and less biased and more precise ones than TE. HE proved to be very effective in the WV procedure. The estimators were applied to five traits evaluated in a cassava experiment, including 358 clones genotyped for 390 SNPs. Accuracies ranged from 0.67 to 1.12 with TE and from 0.22 to 0.51 with RE. These results indicated that TE overestimated the accuracy and led to one accuracy estimate (1.12) higher than one, which is outside of the parameter space. Use of RE turned the accuracy into the parameter space. Cassava breeding programs can be more realistically implemented using the new estimators proposed in this study, providing less risky practical inferences. MenosABSTRACT. Genomic selection is the main force driving applied breeding programs and accuracy is the main measure for evaluating its efficiency. The traditional estimator (TE) of experimental accuracy is not fully adequate. This study proposes and evaluates the performance and efficiency of two new accuracy estimators, called regularized estimator (RE) and hybrid estimator (HE), which were applied to a practical cassava breeding program and also to simulated data. The simulation study considered two individual narrow sense heritability levels and two genetic architectures for traits. TE, RE, and HE were compared under four validation procedures: without validation (WV), independent validation, ten-fold validation through jacknife allowing different markers, and with the same markers selected in each cycle. RE presented accuracies closer to the parametric ones and less biased and more precise ones than TE. HE proved to be very effective in the WV procedure. The estimators were applied to five traits evaluated in a cassava experiment, including 358 clones genotyped for 390 SNPs. Accuracies ranged from 0.67 to 1.12 with TE and from 0.22 to 0.51 with RE. These results indicated that TE overestimated the accuracy and led to one accuracy estimate (1.12) higher than one, which is outside of the parameter space. Use of RE turned the accuracy into the parameter space. Cassava breeding programs can be more realistically implemented using the new estimators proposed in this study, provi... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Accuracy estimator; Cross-validation; Genomic prediction; Mnadioca; Seleção genômica. |
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Thesagro: |
Mandioca; Manihot esculenta; Melhoramento vegetal. |
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Thesaurus NAL: |
Cassava; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/161813/1/2016-M.Deon-GMR-NewAccuracy.pdf
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Marc: |
LEADER 02532naa a2200325 a 4500
001 2072711
005 2018-01-03
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.4238/gmr.15048838$2DOI
100 1 $aAZEVEDO, C. F.
245 $aNew accuracy estimators for genomic selection with application in a cassava (Manihot esculenta) breeding program.$h[electronic resource]
260 $c2016
520 $aABSTRACT. Genomic selection is the main force driving applied breeding programs and accuracy is the main measure for evaluating its efficiency. The traditional estimator (TE) of experimental accuracy is not fully adequate. This study proposes and evaluates the performance and efficiency of two new accuracy estimators, called regularized estimator (RE) and hybrid estimator (HE), which were applied to a practical cassava breeding program and also to simulated data. The simulation study considered two individual narrow sense heritability levels and two genetic architectures for traits. TE, RE, and HE were compared under four validation procedures: without validation (WV), independent validation, ten-fold validation through jacknife allowing different markers, and with the same markers selected in each cycle. RE presented accuracies closer to the parametric ones and less biased and more precise ones than TE. HE proved to be very effective in the WV procedure. The estimators were applied to five traits evaluated in a cassava experiment, including 358 clones genotyped for 390 SNPs. Accuracies ranged from 0.67 to 1.12 with TE and from 0.22 to 0.51 with RE. These results indicated that TE overestimated the accuracy and led to one accuracy estimate (1.12) higher than one, which is outside of the parameter space. Use of RE turned the accuracy into the parameter space. Cassava breeding programs can be more realistically implemented using the new estimators proposed in this study, providing less risky practical inferences.
650 $aCassava
650 $aPlant breeding
650 $aMandioca
650 $aManihot esculenta
650 $aMelhoramento vegetal
653 $aAccuracy estimator
653 $aCross-validation
653 $aGenomic prediction
653 $aMnadioca
653 $aSeleção genômica
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
700 1 $aSILVA, F. F.
700 1 $aVIANA, J. M. S.
700 1 $aVALENTE, M. S. F.
700 1 $aRESENDE JUNIOR, M. F. R.
700 1 $aOLIVEIRA, E. J. de
773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 15, n. 4, gmr.15048838, Oct. 2016.
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Embrapa Florestas (CNPF) |
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